人が歩く下（１階）に仏壇を置くのは良くないと言う人もいますが、これは同じ意味でしょう。
^#仏壇や神棚は、中に蔵うものは違ってもタンスと同じ物体（死物）ですから「気」がありません。従って、家相とは関係ありませんが、精神的なことは人それぞれですから、気になるのならどちらかを移動しなければしようがありません。

風水のことは知りませんが、家相で言うと家の中にある^#トイレは何処にあっても凶と判断しますが、実際この影響を受けたという事例はないとしてもいいでしょう。ただ、中心に近い（壁際でない）トイレが特に悪いというのは、トイレそのものではなく床下の給排水管です。
マンションの場合はほとんどそうなっているようですが、パイプが設置された床上は部屋になっていることが少ないので影響は軽微だと言えます。

「大凶でないが悪い位置もある」が、「悪いところもあるがあなたがたにはその影響を受けにくい」と言う意味なら心配ないでしょう。何故なら、家相の影響は吉凶の別なく^#住む人を選ぶ（住人の生年月日に左右される）からです。つまり、この人には影響大だがあの人にはそれほどでないということですが、これは図面を拝見しないと何とも言えませんし、そのうえでないと回避方法のあるなしもお答えできません。
なお、この点については鑑定のなりますので、この場でのお答えは致しかねますことをご理解願います。